Leider habe auch ich kein Patentrezept für eine sinnvolle Trennung.
Auch wenn ich kein Freund vom DragonSys bin, sollte meiner Meinung nach da schnell nachgebessert werden. Vielleicht ein "Libere Clericalis"?
Das Problem: Man müßte erstmal die ganzen Gottheiten katalogisieren (und das stelle ich mir recht schwierig vor). Denn die Wunder sollten immer ensprechend dern Göttern zugeordnet sein.

Wenn schon ein Paladin den Bonus hat, in Rüstung Wunder wirken zu dürfen, dann sollte er sich auch entsprechend selbst beschränken.
Es gibt genügend Paladine, die Zauber anwenden, die nicht zu ihnen passen.

Gruß
Tobias